MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012578	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012578	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012578	CTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012578	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012578	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012578	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012578	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012578	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012578	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012578	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012578	GACGCC	2	12	4702	4713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012578	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012578	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012578	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012578	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012578	TG	3	6	7101	7106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012578	AGT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012578	ATCAAA	2	12	7187	7198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012578	ACT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012578	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012578	GA	3	6	11090	11095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012578	A	6	6	13548	13553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012578	GCT	2	6	13567	13572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012578	T	7	7	13572	13578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012578	TCCCT	2	10	13593	13602	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012578	GTT	2	6	13672	13677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012578	TTA	2	6	13734	13739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012578	T	6	6	13748	13753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012578	CATT	2	8	13774	13781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012578	T	7	7	13780	13786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012578	T	7	7	13827	13833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012578	T	7	7	14544	14550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012578	A	7	7	14552	14558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012578	GAG	2	6	14660	14665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012578	TG	3	6	16573	16578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012578	CCG	2	6	16607	16612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012578	GGC	2	6	16703	16708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012578	GTTC	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012578	TTG	2	6	16842	16847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012578	TGC	2	6	16860	16865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012578	AAT	2	6	19973	19978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012578	TC	3	6	20017	20022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012578	GGT	2	6	20068	20073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012578	CA	3	6	20131	20136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012578	GT	3	6	20165	20170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012578	ACAA	2	8	20205	20212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012578	CG	3	6	20845	20850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012578	AAGAGT	2	12	20923	20934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012578	A	6	6	21215	21220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012578	T	6	6	21237	21242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012578	ACC	2	6	21257	21262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012578	GAT	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012578	TGG	2	6	21578	21583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012578	ATT	2	6	21590	21595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012578	AAT	2	6	21597	21602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012578	TGAC	2	8	21863	21870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012578	T	7	7	21934	21940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012578	TTTC	2	8	21997	22004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012578	AGT	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012578	ATGG	2	8	23062	23069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012578	AAGCGA	2	12	23077	23088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012578	CTAT	2	8	23102	23109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012578	AAAGAG	2	12	23221	23232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012578	CCT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012578	CAA	2	6	29551	29556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012578	TG	3	6	29575	29580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012578	TTC	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012578	TATC	2	8	29658	29665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012578	T	7	7	29697	29703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012578	GTCT	2	8	29705	29712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012578	A	7	7	29720	29726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012578	T	7	7	29751	29757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012578	CGT	2	6	29794	29799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012578	T	6	6	29870	29875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012578	AC	3	6	29922	29927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012578	T	6	6	29960	29965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012578	CAC	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012578	TA	3	6	29992	29997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012578	T	7	7	31653	31659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012578	T	6	6	35834	35839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012578	TCAA	2	8	35857	35864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012578	AAC	2	6	35895	35900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012578	TTC	2	6	35915	35920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012578	TAA	2	6	35936	35941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012578	A	7	7	35940	35946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012578	CGC	2	6	35955	35960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_012578	ACTT	2	8	36083	36090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012578	GCC	2	6	36091	36096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012578	GTT	2	6	36112	36117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012578	CAG	2	6	36127	36132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012578	ATT	2	6	36134	36139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012578	CAG	2	6	36143	36148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012578	A	6	6	36495	36500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012578	AAT	2	6	36823	36828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012578	ATTT	2	8	36902	36909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012578	TTTG	2	8	41947	41954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012578	CCAT	2	8	43309	43316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012578	TCA	2	6	48253	48258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012578	GGTA	2	8	53332	53339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012578	TAG	2	6	53340	53345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012578	A	6	6	53409	53414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012578	A	6	6	53547	53552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012578	ACA	2	6	53562	53567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012578	GCC	2	6	53586	53591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012578	TCT	2	6	53592	53597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012578	AGA	2	6	53613	53618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012578	CAAT	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012578	TG	3	6	53649	53654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012578	TGA	2	6	53664	53669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012578	A	6	6	53770	53775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012578	GGC	2	6	53817	53822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012578	GCA	2	6	53848	53853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012578	GCG	2	6	53881	53886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012578	CGA	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012578	GAT	2	6	54081	54086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012578	GCA	2	6	54130	54135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012578	GAA	2	6	54189	54194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012578	GGT	2	6	54232	54237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012578	AGA	2	6	54272	54277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012578	CAG	2	6	54298	54303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012578	GGT	2	6	54363	54368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012578	G	6	6	54445	54450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012578	GGC	2	6	54509	54514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012578	GAA	2	6	54752	54757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012578	TGC	2	6	54828	54833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012578	GTC	2	6	54840	54845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012578	TGG	2	6	54918	54923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012578	GGA	2	6	54954	54959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012578	GAC	2	6	54967	54972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012578	TCA	2	6	54979	54984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012578	AC	3	6	55005	55010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012578	CGT	2	6	55073	55078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012578	AC	3	6	55174	55179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012578	AAG	2	6	55210	55215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012578	GGA	2	6	55234	55239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012578	CCT	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012578	GAT	2	6	55326	55331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012578	TGA	2	6	55337	55342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012578	CA	3	6	55348	55353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012578	GATT	2	8	55354	55361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012578	GCATG	2	10	55414	55423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012578	CCA	2	6	55455	55460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_012578	TCA	2	6	55500	55505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012578	ACA	2	6	55544	55549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012578	TTG	2	6	55555	55560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012578	CAA	2	6	55598	55603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012578	GTT	2	6	55709	55714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012578	ACA	2	6	55718	55723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012578	GAG	2	6	55957	55962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012578	GTA	2	6	55984	55989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012578	GCG	2	6	55990	55995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012578	G	6	6	56142	56147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012578	TCC	2	6	56152	56157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_012578	CTGA	2	8	56172	56179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_012578	GTAC	2	8	56256	56263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_012578	GTG	2	6	56283	56288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012578	GGA	2	6	56460	56465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012578	TAC	2	6	56583	56588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_012578	AC	3	6	56677	56682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_012578	CGTC	2	8	56695	56702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_012578	AAC	2	6	56714	56719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_012578	CT	3	6	57232	57237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_012578	GGT	2	6	57351	57356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012578	GA	3	6	57381	57386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012578	TTA	2	6	57508	57513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012578	GCAA	2	8	57599	57606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_012578	CGG	2	6	57632	57637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_012578	ACC	2	6	57903	57908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_012578	TGG	2	6	57963	57968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012578	TCC	2	6	57989	57994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_012578	GGT	2	6	58126	58131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_012578	TTG	2	6	58716	58721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_012578	TCCGC	2	10	58971	58980	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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232	NC_012578	T	6	6	85448	85453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_012578	AAG	2	6	86258	86263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
234	NC_012578	TGA	2	6	86324	86329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_012578	T	6	6	102368	102373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012578	TAT	3	9	102405	102413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012578	A	6	6	102581	102586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_012578	CTTTTT	2	12	102629	102640	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
275	NC_012578	TCTCGC	2	12	102651	102662	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
276	NC_012578	ATTTT	2	10	102819	102828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012578	T	8	8	102839	102846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_012578	TTAC	2	8	103038	103045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
279	NC_012578	A	7	7	105935	105941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_012578	TGT	2	6	105964	105969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012578	A	8	8	105987	105994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_012578	A	6	6	105999	106004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_012578	TTG	2	6	106024	106029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_012578	GCC	2	6	106113	106118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_012578	TAT	2	6	106285	106290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_012578	AGC	2	6	106356	106361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_012578	TC	3	6	106465	106470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_012578	TGG	2	6	106488	106493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_012578	AAAG	2	8	154347	154354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_012578	AGTCG	2	10	154369	154378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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466	NC_012578	CT	4	8	154762	154769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_012578	CGG	2	6	155162	155167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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